El País Vasco cuenta con tres aeropuertos, cada uno en los alrededores de sus tres capitales de provincia:
–El aeropuerto de Bilbao, se encuentra a 12 km de la ciudad y es el principal aeropuerto del País Vasco. Se puede llegar al centro de la ciudad con la línea de bus A3247 (precio 3€), alquiler de coche, taxi o transfer privado.
– El aeropuerto de Vitoria se encuentra a 8 km de la ciudad. Es un aeropuerto pequeño , con poca cantidad de vuelos y al que llegan compañías low cost.
– El aeropuerto de San Sebastián se encuentra a 20km de la ciudad, en el operan compañías como Iberia, Vueling y British Airways. Este aeropuerto está comunicado con el centro de San Sebastián por numerosas líneas de bus (E20, E21, E28)